生物學、25.基因演化

 25.基因演化

基因定序：

人類基因定序：連鎖圖譜、物理圖譜(標示基因標記間隔數)，雙去氧核苷酸終止法(d-NTP~2’3’)

                    霰彈型全基因定序法>打斷基因組~1M個重新組合，快但精準低(無法測蛋白質修飾

已定序：大腸桿菌、酵母菌、玉米，阿拉伯芥，秀麗線蟲，果蠅、章魚、鼠、猴

                 *2015>定序加州雙斑魚：研究脊椎動物腦神經科學

模式生物：充分了解、完全定序 >繁殖快、基因體小、生命週期短 >ex秀麗線蟲:研究凋亡

蛋白質體學：

研究編碼蛋白質體(組織表現的蛋白質總和)>二維電泳(等電量+分子量)、質譜儀

      癌症基因體圖鑑：肺癌、卵巢癌、乳癌BRCA、腦神經母細胞瘤>快速檢測

        *真核生物大小與基因體大小無關，人類=3000Mb ，衣苙草有14.9萬Mb

          *但基因體越大基因密度越低  >細菌無內含子，多數DNA可轉為t/rRNA=密度高

出處：維基百科

人類基因：

         功能外顯子(Exon)：1.5%  (可編碼表達為蛋白質)，

         內含子(Intron)：20%      (無用，5-GT....AG-3 )

         可轉位重複元件=轉位子(Transposon ) L1、Alu：44%

         非轉位重複DNA ：15% (端粒Telomere)

         偽基因(突變或轉位失去功能的演化化石)：15%

自剪接內含子：I；II型 > 粒線體、葉綠體、細菌、部分低等真核生物的rRNA基因

剪接體內含子：要有剪接體，Ⅲ型 > 真核细胞前mRNA；Ⅳ型 > tRNA及其初级轉錄產物

 

轉位子：染色體的插入、刪除和移位，彎曲DNA酵素，跳躍基因Alu元件複製貼上。

 I 型轉位子：反轉錄RNA插入基因組，複製後粘貼，L1元件，80%內含子擁有，神經分化

 II 型轉位子： 兩端回文序列(dR iR)包中間DNA，剪切後粘貼

*反轉錄：以RNA為模板反轉錄合成cDNA，再由cDNA轉錄出RNA

*細菌：唯一序列  ；雷同基因：血紅素> a球蛋白=16染色體、B球蛋白=11染色體

*粒線體無核糖體，RNA借用細胞核糖體  (原核生物有粒線體RNA基因)

重排+序列突變有助演化：溶菌酶演化成a乳清蛋白  ；膠原蛋白=重複外顯子

24.DNA科技  ↼   25.基因演化  ⇀ 26.免疫系統